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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抵抗能力种类特异形、寡核苷酸体现费用高涨或操作步骤流量比较复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯传授技术团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低直接费用、跨动物群、全手机平台兼容的全新解决方案。

中文核心期刊简绍

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由在我国学科院基因遗传性基因的与发展怪物学调查所和在我国基因遗传性基因的学着主办方的新国际学术研究交流杂志,锐意创新于了解生命值学科和临床医学基因遗传性基因的学探讨方向的全球独特原创性调查工作成果。JGG 2025年度导致要素7.1,Scopus学术研究交流杂志评论指標CiteScore 9.9,居首JCR 2025年度GENETICS & HEREDITY探讨方向Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY探讨方向Q1区,居首在我国学科院杂志划分怪物学学科门类1区(Top杂志),基因遗传性基因的学和菌物化与分子式怪物学小类双1区。

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怎样的是HEATag

完美的“二合并”定制

HEATag是由凝集素和HUH内切酶制成的相结合血清

「wifi定位器」模快 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化掩盖(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「连入器」组件 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)指数条型码确定共价连入。

“1+1>2”的治疗效果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行范例符号与追溯。

Fig1: HEATag许多符号道理关心图

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实操质量检验

HEATag真的有多用打?

可以在不同的生活条件下,保证哺乳期间动物界肿瘤细胞系系单肿瘤细胞系混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。分析团对为 HEATag 设计了多轮 “压力差检验”,从神经肿瘤细胞系到神经肿瘤细胞结构,从温度到温度,从新鲜子子样本到规定子子样本,全东南方向认证它的平衡性和准确性。

一是轮各种测试对於喂母乳部分动物组织細胞系:研发职工选了是来自于人、鼠、仓鼠4个种群的4种组织細胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在温度下能 HEATag 标记图片后混合着测序。然后收废的 11447 个组织細胞中,85.66% 都能根据 HEATag 方形码精准连接到原种群,子样本间交叉式严重污染较少,UMAP 聚类分享法分享更多的是随便证明信,HEATag 方形码与种群特异形DNA组表现长度相同。 又,检测状况进的一步版本升级:论述技术人员试过在 4℃下符号最新毛肚癌组织、在环境温度下符号甲醇统一癌组织,而且单独符号癌组织核。数据还优异:整个状况下,模板产品标签与外来物种新信息均包括较好的有关性,转换更准率超 95%。即使是甲醇统一会引发一些的转录本交叉重合环境污染,癌组织核提纯都会有小量 RNA 短缺,癌组织品类的注音数据还与最新毛肚模板保护不符,事实证明 HEATag 能够符号有差异 外理状况下的实验性模板。

Fig2: HEATag 可在不一先决条件下做好单肿瘤细胞转录组混样具体分析

够标记图片辅乳猎物和浅海无脊椎神经猎物的原代神经元

如若说肿瘤細胞系检验是 “根基题”,那组织化样品便是 “额外增加题”, 哪些样品因此因肿瘤細胞方式错综复杂、学习环境可塑性性特异,变成 标记图片新技术的 “关键点”,而 HEATag 恰恰恰在哪些 “关键点” 上浮现了的优势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组识,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞并不是能被准确无误划分,整个重点细胞膜类的聚类分析报告都分明可辨。

更令人惊喜的是HEATag对深海生物学的自适应性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 条状码与种群转录组享有较高统一性,还没有现身因高盐的环境促使的 “标出就失效”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可完成乳期動物组建样品丰富 scRNA-seq 讲解

Fig4: HEATag可保证 清爽海洋环境无脊椎神经各种动物很多 scRNA-seq 进行分析

HEATag与组织细胞的综合不用因起转录组的更为明显变换

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在完毕记号钓鱼任务的一起,不用对未果的转录酚类化合物析造干忧,以确保了探索数据源的最正确性。

Fig5: HEATag就不会决定范本的 RNA 抒发传统模式

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的前景可期

HEATag 能为单生殖细胞探索创造任何?

HEATag 的实用价值,远不仅于 “缓解标识问題”,它的灵敏性和普遍意义,也在为单组织科研点开更好机会性

从广泛应用场境一起来看

HEATag 能遮盖从 “简洁明了更探索”(如癌组建与常规组建、性药物治理 与参考)到 “新一轮较探索”(如组建组织细胞核图谱制图、高通骁龙量淘汰)的全依据具体需求。渐渐 PIP-seq、Stereo-cell 等新可加密技术工艺的壮大,HEATag 还能进的一步加强单组织细胞核探索的通量,动力科研课题公司做更新一轮较的工程项目。

从跨范畴潜力股看你

HEATag 不止可中用于转录组学,还能与表观dna组学、球脂肪酸组学、服务器组学等技能结合起来,经过定做字段和寡核苷酸字段,HEATag 能轻易加上各种不同的组学程序,不直接影响警报获取淬硬层。并且,鉴于HEATag还能发展前景单神经细胞糖组学科研技能。

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的合作动图

拜谱动物与陈凯副教授确定大概配合有意向的客户

指的大家关注的是,在 HEATag 技艺水平工艺出出现不小应该用有潜力的大环境下,拜谱深海动物已与北方深海科学课与工程施工惠州市实验性英文室(成都)陈凯教受确定大概达成合作有意向的。夫妻双方进度表紧紧围绕 HEATag 技艺水平工艺的服务业化洛地、研发转变等层面选取的深度协同合作,带动一种成本控制费、跨植物物种的单体组织细胞系标出技艺水平工艺速度快应该用于实计研发应用场景,为其他实验性英文室带来了优质、生活的单体组织细胞系探索道具,助推研发岗位者在体组织细胞系深海动物学、深海深海动物学、慢性病体系等层面完成其他突破点
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