
近日,扬州医科高校首位附加诊所王学浩科学院院士技术团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向疗法电能分解检测分析服务。
国外英文一级标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文版关键词:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
企业客户组织:南京医科大学
探析板材:细胞
拜谱展示 服务管理:转录组测序+球蛋白互作组+靶点热量新陈代谢组
技艺交通路线:
论述结论
01、YBX1被鉴定费为HCC中糖酵解的重中之重人类基因
本的研究的大数据采集HCC恶性良性良性肺部肿瘤样板(n=7)的单体癌组织细胞RNA测序的大数据集开始大数据具体剖析,遇到糖酵解生物注意集中化在恶性良性良性肺部肿瘤体癌组织细胞中,hdWGCNA大数据具体剖析辨别出9个基因遗传模块电源(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的生活工作大数据具体剖析选择YBX1为独力生活工作风险隐患要素(图1H)。进一部切合IHC、WB测试和恶性良性良性肺部肿瘤集体与周围非恶性良性良性肺部肿瘤集体的空间区域转录组学的大数据集灵魂存在YBX1是肝体癌组织细胞癌开展的潜在性的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确认为缓解HCC组织细胞糖酵解的重要影响
02、YBX1使得HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点体力分解代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1增强HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1整合并加速YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,血清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1构建并有利于促进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提高其磷过酸,所以有利于促进其核转位
进这1步在线检测YBX1的O-GlcNAc糖基化是关系其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC癌上皮细胞中或用OGT缓和剂OSMI-1解决,YBX1球蛋清品质方向有效消减,YBX1磷酸性反应有效缩减(图4A-C)。IP实验英文呈现,在重复的Flag-YBX1底物品质方向下,YBX1-WT的磷酸性反应品质方向有效优于YBX1-T57A,认为磷酸性反应的上升不禁仅是毕竟更高的的YBX1球蛋清表答(图4D)。剥离 了核和质混合物看见TMG解决的HCC癌上皮细胞中YBX1核表答的增高(图4E-F),进这1步看见YBX1磷酸性反应的关键性调要素是AKT(图4G-I)。这个看见表示O-GlcNAc糖基化可以通过催进其磷酸性反应来资料YBX1球蛋清安稳性并催进核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 掩盖有效于其进第一步发现磷酸性反应掩盖并够使得其核转位
05、YBX1利于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1带动PKM2转录
06、YBX1 并能挺高组淀粉酶乳硝化作用掩盖层次
钻研察觉到YBX1敲低重要减轻蛋清质乳酸性反应,针对是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解缓和剂2-DG的试验查证了糖酵解与组蛋清乳酸性反应的随便相关联,缓和糖酵解可重要减轻H3K18la程度(图6D)。PKM2过表现不可逆转转YBX1敲低引致的H3K18la减低,以外源乳酸处理不大幅提升H3K18la,还伴YBX1表现调整,显示系统会有朝评议(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR查证,H3K18la实现丰度于YBX1通电子随便利于其转录,该的时候受O-GlcNAc糖基化改善(图6H-J),并察觉到P300 调整是YBX1强化H3K18乳酰化为用的机能(图6K-L)。
图6.YBX1激发H3K18乳酸性反应遮盖能力
原创文章个人心得体会
在这一种项科研中通讯稿了YBX1在HCC中高展现方式,与此同时与糖酵揭秘切涉及。YBX1在T57处被O-GlcNAc绘制,而使平稳球蛋白酶质并添加其展现方式。这般绘制还带动YBX1在T57处的磷酸性反应,带动其核易位。所以,这一种时候减弱了糖酵解涉及dna的转录并畅快乳酸的带来。还有就是,YBX1更改密码P300的转录,随之推动组球蛋白酶的乳酸性反应,越来越是H3K18la,H3K18乳酸性反应正在向改善YBX1dna转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传性正反两面馈环机理图
拜谱总结ppt
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱菌物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向疗法激光能量代谢转化组技术服务,拜谱微生物建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、当地翻译后绘制组学、新陈代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
借鉴论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.