
2024年9月由沈阳农林牧专科大学张万刚教援管理团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生态学为该研究提供了亚硝基化突显组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文翻译主题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
论文期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202几年后果细胞因子:5.7
收录期限:2024年9月
雇主机关单位:南京农业大学
分析材质:蛋白
拜谱给出工艺:亚硝基化修饰组学
技术工艺行车路线:
一、探究最终
01.Caspase-3可溶性
日前尚不清理NO对caspase-3的仰创效应需不需要归因于NO介导的S-亚硝基化,不一样氨水浓度系数的GSNO身为外源性NO生产,以诱导型caspase-3的体内S-亚硝基化。成果显示,与没能GSNO的组比起,100、200和400μM GSNO组的caspase-3亲水性同质性调低(图1),与此前简报不一。GSNO治理调低caspase-3亲水性的隐藏的愿意仍尚待揭示。
图1 有所差异浓硫酸浓度的GSNO进行处理对caspase-3催化活性的导致
02.Caspase-3的S-亚硝基化系数
探析Caspase-3的亚硝基化的情况,以体现了GSNO对Caspase-3的作用性。经GSNO清理后,检查到caspase-3蛋白酶S-亚硝基化挠度新增(图2)。等最终结果意味着,外源性GSNO养育可成功的英文帮助caspase-3的休外S-亚硝基化。更让人惊艳的是,在不能GSNO会出现的差表组中检查到一两个很弱的S-亚硝基化带,这意味着caspase-3有机会会出现内源性的S-亚硝基化。凡此种种,本探析中caspase-3的S-亚硝基化的情况较高,而caspase-3的化学活化降底,这与前的探析不对。但,caspase-3的特情人S-亚硝基化遮盖位点尚不明了,还须要进一个步骤的挑战。
图2 GSNO外理对caspase-3S-亚硝基化技术的作用
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化淡化组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。颜色图标的队列提出S-亚硝基化肽,黑色图标的C提出S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3可降解结淀粉酶
结球淀粉酶当作另外一种注重的组织组织骨架球淀粉酶,在能维持肌组织组织构造的构造全版性和缩水性方向起着注重的作用,设计S-亚硝基化caspase-3对结球淀粉酶可吸附的强烈性兼备注重目的意义。与Std(未用胱天球淀粉酶酶-3和GSNO孵育的刚开始肌人造食物纤维球淀粉酶)组相对于,0 μM GSNO组(肌原人造食物纤维和caspase-3的孵育,无GSNO)的全版结球淀粉酶份量不错降低,温馨提示caspase-3对结球淀粉酶兼备不确定的球淀粉酶淀粉水解作用。在GSNO孵育后,全版结球淀粉酶的份量看不出增多(P < 0.05)。不仅如此,当GSNO溶液浓度提升时,全版结球淀粉酶的份量维持上浮(P < 0.05)(图5)。哪一看到取决于,SNO装饰的caspase-3以水准依耐的方案调控结球淀粉酶的可吸附。
图5.S-亚硝基化caspase-3生物降解结血清
05.S-亚硝基化Caspase- 3化学降解肌钙淀粉酶-T
肌钙蛋清质-T (TnT)是原肌球蛋清质调低承当肌肉组织抽缩的丝条的都要肌原氯纶蛋清质。TnT的吸附特征描述是监测工具到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化要求下,caspase-3对TnT的吸附状态表达6表达,与Std组(还没有caspase-3和GSNO的肌原氯纶)相对于,caspase-3组中30 kDa TnT情节有效提升,是因为caspase-3参予了TnT的吸附,还有,caspase-3与GSNO的孵育使得30 kDa TnT下调。在100和200 μM GSNO组中间还没有监测工具到更为明显的的距离(P > 0.05),而当GSNO的氧化还原电位达到400 μM 时,该情节有效减轻(P < 0.05)。一些发现是因为了SNO表达的caspase-3对TnT吸附的控加工制效应。结蛋清质和TnT是caspase-3的的敏感底物,而GSNO办理消减caspase-3的催化活性氧可能使得肌原氯纶蛋清质吸附成度消减。结合以上指出,NO成脂的S-亚硝基化也可以用表达半胱氨酸残基来调低caspase-3的催化活性氧,而能进这一步后果其对结蛋清质和TnT的蛋清质淀粉水解本事,可以后果牛肉片品味。
图6. S-亚硝基化caspase- 3光降解肌钙蛋清-T
二、总结
本研究研讨为了更好地研讨S-亚硝基化对caspase-3绘制的印象举例接着随后对牛羊肉片肌原仟维身体外降解塑料的印象。淀粉酶S-亚硝基化都可以绘制caspase-3的半胱氨酸残基,因此诱发caspase-3活力减小,进第一步缓和了其对牛羊肉片肌原仟维淀粉酶的淀粉酶淀粉水解实力。三、拜谱总结ppt
钻研运用了酶活测试,亚硝基化遮盖组学分享,WB等加测策略,发展蛋清酶S-亚硝基化能够 遮盖caspase-3的半胱氨酸残基,这出现了caspase-3渗透性的变低,并举那步抑制性了其对羊肉肌原纤维材料蛋清酶的蛋清酶淀粉水解功能。本钻研为回答蛋清酶质亚硝基化对肉质地的自我调节制度化提供了一个新的视野。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的球胆固醇组学、修饰语球胆固醇组学、新陈代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系列的物料,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total阳极氧化复原、游离于巯基,欢迎大家咨询!
考虑学术论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663