
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱动物 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探究结杲
学习人科学探究根据食品冷库时长延长至时间间隔鸡肉的光洁度、持水技能、茶汤颜色、矿酸铁份量、ROS、脂质过腐蚀物、MDA、GSH和GPX4的水平来评估报告力量策划 癌细胞核的铁致死工作状态。数据呈现,食品冷库时长延长至时间间隔后,鸡肉的光洁度在第5天和第6天强势性走低;持水技能降低了;茶汤颜色变深,有了光泽度,鲜颜色转换成暗颜色。然而,矿酸铁、活性酶类氧和MDA的份量强势性上升,癌细胞核凋亡率强势性提高。 研究方案员获取各种各种要在冷藏室保存日子的肩部肌肤试样的淀粉酶酶质,最后使用SDS-PAGE具体概述,淀粉酶酶质条带在各种各种晚唐时期分散匀称且相类似(图1a)。通过淀粉酶酶在各种各种试样中的抒发展状,具体概述发展相同组试样的中六位数临近于相同水平面(图1b),情况说明肩部肌肤试样淀粉酶酶质拥有保持良好的组内相类似性和组间区别性。 淀粉酶质组学共亲子监定结论出1996种淀粉酶质。以B0为比对组,挑选B1、B2、B4和B6中的淀粉酶做出的差异性传达方式深入深入分析,共亲子监定结论到37几个DEPs。将火山图web3d,并依据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05这两个规则深入深入分析DEP。毕竟右图1c-f所表示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别亲子监定结论出22、33、73和140个DEPs,在当中别调涨6、11、32和85个,调低16、22、41和5多个。聚类算法工艺测评了各种不同冰箱的阶段肩部肌进行中淀粉酶质的传达方式,毕竟表示肩部肌淀粉酶传达方式的差异性伴随吸收时间间隔的不断增高而不断增高(图1g)。
图1| 不相同保鲜冷库准确时间的肌肉群样机蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不同于冷冻冷藏时长的健身肌肉样品英文的差异核蛋白浅析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死掉蛋白酶肽的PRM化学发光法研究(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 特征提取KEGG聚集相互影响表达方式血清的铁自杀考核机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物技术提供了TMT按量球胆固醇组学新技术工艺售后服务保障,拜谱海洋生物已研发部来完成并建设了旺盛期的旺盛期的转录组学、球蛋白质组学、分解组学包括几组学合力的产品新技术工艺售后服务保障保障体系,欢迎致电咨询!
参照期刊论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.